2013/04/16

次回 Cochrane Systematic Review 4月24日(水)14:30-

前回(4/12)は9章 Analysing data and undertaking meta-analyses の
9.3 Study designs and identifying the unit of analysis から
9.4 Summarizing effects across studies までを行いました。

まず、前回の(9.1と9.2)の振り返りを簡単にしてもらってから9.3 Study designs and identifying the unit of analysis に入りました。
報告バイアスについてや、イベントが複数回発生する場合、治療回数がいろいろな場合、複数の身体の部分に同じあるいは違う治療を受ける場合、複数の介入群がある場合などについては注意が必要だということでした。

9.4 Summarizing effects across studies では、メタアナリシスの原則やweightが出てきました。random-effects meta-analysis(変量効果メタアナリシス)とfixed-effect meta-analysis(固定効果メタアナリシス)や、inverse-variance method(分散逆数重み付け法:IV法)といったものが印象に残りました。
二値データの場合にはどうするか?連続量では?変化量か最終時点での値か、データがゆがんでいる時は、順序データでは?回数カウントや発生率のデータは?Time-to-event型データでは?といろいろありました。これは実際に自分でRevManに入れてみるとより理解が進むのかなぁ、と思いました。
個人的にはvote counting(p.276)が気に入りましたが、これは最後の手段(last resort)なのだそうで。
というわけで、盛りだくさんな内容でした。

米倉さん、大変なご準備をどうもありがとうございました。一人では絶対に読み進める自信のない章でして、日本語にして言葉で説明してくださって本当に有り難く感謝しております。

次回は予定通り高野さんの10章にまずはいっていただき、その後で9章に戻る予定です。

日 時:2013年4月24日(水)14:30~15:30
テーマ:Cochrane Systematic Review (Chapter 10)
場 所:医学部3号館 3階S308N304(図書室)


です。さらにその次は
5月13日(月)10:30-11:30 9章(9.5 Heterogeneity から)
を予定しています。

資料はpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第10章(Addressing reporting biases)はp.297-333
第9章(Analysing data and undertaking meta-analyses)はp.243-296
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。資料の準備がありますので、可能であれば事前に宮本(yyuki-tky@umin.ac.jp)までご連絡いただけるとありがたいです。
                 (文責:宮本有紀)

2013/04/01

次回 Cochrane Systematic Review 4月12日(金)14:00-

前回(3/27)は、コクランレビューの8章と9章の途中まで行いました。

8章では特に、p.198のTable 8.5.c Criteria for judging risk of bias in the
‘Risk of bias’ assessment toolを見ながら、
実際にRoselineが準備してくれた
Cupples ME, McKnight A.
Randomised controlled trial of health promotion in general practice
for patients at high cardiovascular risk.
BMJ. 1994 Oct 15;309(6960):993-6.

をJudgeしてみるという演習を行いました。

9章では、二値データ、連続データ、順序データ、係数や割合、生存時間データについて、
risk ratio (RR), odds ratio (OR), risk difference (RD), numbers
needed to treat (NNT),
standardized mean difference (SMD),
などの使い方や注意点などを学びました。

ロザリン、よねちゃん、お忙しいところ、ご準備をどうもありがとうございました。

次回は
日 時:2013年4月12日(金)14:00~15:00
テーマ:Cochrane Systematic Review (Chapter 9)

(9.3 Study designs and identifying the unit of analysis から)
場 所:医学部3号館 3階S308

です。
さらにその次は
4月24日(水)14:30-15:30 Chapter 10 Addressing reporting biases
を予定しています。

資料はpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第9章(Analysing data and undertaking meta-analyses)はp.243-296
第10章(Addressing reporting biases)はp.297-333
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
                 (文責:宮本有紀)

2013/03/06

次回 Cochrane Systematic Review 3月27日(水)13:00-

前回(2/28)はコクランハンドブックのChapter 7 (Selecting studies and collecting data) について梅田さんがご発表くださいました。
以前何度かSystematic Reviewをした際に、Data collection formを作成するのに四苦八苦した身としては、システマティックレビューをし慣れている方の機能美あふれる(かどうかはわかりませんが)Formというのを見てみたいなぁと思いました。

また、どのようなデータをどのように抜き出すかを考えると、次から自分が論文を書く時に気をつけるポイントへの気付きが増えるだろうなぁと感じました。

次回は
日 時:2013年3月27日(水)13:00~15:00
テーマ:Cochrane Systematic Review (Chapter 8 and 9)
場 所:医学部3号館 3階S308

です。1章につき1時間の予定です。

pdf版↓ 
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第8章(Assessing risk of bias in included studies) p.187-242
第9章(Analysing data and undertaking meta-analyses)p.243-296
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
                 (文責:宮本有紀)

2013/02/20

次回 Cochrane Systematic Review 2月28日(木)15:00-

前回(2/13)はコクランハンドブックのChapter 6を読みました。
MEDLINEとEMBASE、CENTRALはまず検索、ということや、grey literatureについて、報告書等の英文タイトル表記について、文献検索をする際の用語(AND ORだけでなく NEAR NEXT ADJ)など、もっと早く知っていれば。。。。という内容でした。

こういったものをちゃんと勉強することの大切さを感じました。

次回は
日 時:2013年2月28日(木)15:00~16:00
テーマ:Cochrane Systematic Review (Chapter 7)
場 所:医学部3号館 3階S308

です。

pdf版だと↓の p. 151-186 が次回の第7章になります。
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf


ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
                 (文責:宮本有紀)

2013/01/31

次回 Cochrane Systematic Review 2月13日(水)10:00-

今回(1月31日)は、Chapter 5 (Defining the review question and developing criteria for including studies)を読みまして、Review Questionを決める際に考えることを確認したり、研究レビューを行う上で大事なことを話し合いました。
また、CochraneのReviewに掲載されている、Plain Language Summariesや、研究をみんなに分かる言葉で表現すること、どの相手に届けるかによって言葉も変わってくることなどについて話し合いました。
Cochrane reviewにかぎらず、どんなレビューを行なう上でも大事なことだなぁ、と感じることがたくさんあり、とても短い章でしたが、勉強になりました。

●2月下旬の日程変更 (2/27→2/28木へ。時間は午後へ)があります。ご確認をお願いいたします。
3月以降の日程は次回決めたいと思います。

次回以降の日程です。
2月13日(水)10:00-11:00
2月28日(木)15:00-16:00

次回は
日 時:2013年2月13日(水)10:00~11:00
テーマ:Cochrane Systematic Review (Chapter 6)
場 所:医学部3号館 3階S308

です。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
                 (文責:宮本有紀)

2013/01/29

次回 Cochrane Systematic Review 1月31日(木)14:00-

前回からCochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions になりました。

次回は
日 時:2013年1月31日(木)14:00~15:00
テーマ:Cochrane Systematic Review (Chapter 5)
場 所:医学部3号館 3階S308


です。
次回以降の日程は
1月31日(木)14:00-15:00
2月13日(水)10:00-11:00
2月27日(水)10:00-11:00 →2月28日(木)15:00-16:00
です。
これ以降の日程は、2月の会で決めさせていただけたらと思います。

まずは、
Part 2: General methods for Cochrane reviews の5章から12章をまず読むこととしました。
一回に1章くらいずつ進んで行けると良いかと思います。

参加者それぞれが目を通してくることを前提として、その章の担当者は簡単な資料で内容を紹介し(担当者が皆に全てを教えるのではなく)、参加者で話し合ったり自分の経験をシェアしたりしましょう、と話しています。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
                 (文責:宮本有紀)

2013/01/11

共分散構造分析 2012年8月7日(火)18:30- の記録

2012年8月7日のエビ研の記録の下書きが途中まであったことに気付きました。
でも、残念ながら、続きがどれかわからなくなってしまいました。。。
何も記録がないよりは、少しはあるほうがまだ良いかと思い、中途半端ではありますが、アップさせていただきます。股村さん、ご発表ありがとうございました。せっかくのご発表だったのに不十分な記録でごめんなさい。

-
前回(8月7日火曜日)のエビ研では、股村さんがご自分の研究の方法やデータを見せてくださり、SEMについて学びました。

シンプレックスモデル:auto-regression model
(交差遅延モデル:cross lagged model)

潜在曲線モデル 
Hierarchical growth modelと潜在変数を使ってるかどうかの違いであって、やってることは同じ。

Intercept mean variance
Slope

T1, T2, T3, T4, Time

T1 = Intercept
T2 = Intercept + Slope
T3 = Intercept + 2* slope
Tk = Intercept + Slope * time

重回帰モデルだとvarianceは出てこない。

Intercept は人によって違う
Slope は人によって違う
個人ごとにばらつきがある

Mixed modelならばらつきが出る。

潜在曲線モデルはパス係数を固定する

SEMはMixed model よりできることが多い

Mixed Modelでは、InterceptとSlopeのVARIANCEと平均を推定するところで終わりだが、SEMはそれを従属変数にしたりもできる。

SEMは従属変数に二値変数はだめ 説明変数にする分にはまぁ構わない

エビ研を2012年9月28日(金)に行いました

気づいてみれば、ずっとエビ研のブログを更新していなかった事に気づきました。
9月28日にもエビ研を開催したのに、その予告すら載せておりませんでした。
もしも、ここで見てくださっていた方がいらっしゃったとしたら、申し訳ありませんでした。

9月28日(金)は、SEMで、Roselineがご自分の研究データを紹介してくれながら勉強会を行いました。
Roseline、よねちゃん、どうもありがとうございました。

当日のメモを見つけられずにいますが、また見つけたらアップします。。。

次回からシステマティックレビュー 2013年1月17日(木)14:00-

お久しぶりのエビ研のご案内です。
このところ共分散構造分析(SEM)をテーマとしてきましたが、次回から
システマティックレビューについて学ぶことをテーマにしたいと思います。

しばらく
Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions
を読む会にしようと話しています。

まずは次回予告です。
日 時:2013年1月17日(木)14:00~15:00
テーマ:Cochrane Systematic Review (分担など)
場 所:医学部3号館 3階S308


Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventionsについて

このハンドブックは、下記から無料でダウンロードできますし、
http://www.cochrane.org/training/cochrane-handbook
本(ISBN: 978-0-470-69951-5)として
WileyAmazon.comから購入することもできます。
コクランレビューを執筆するためのハンドブックとしてももちろんですが、普通にシステマティックレビューをする時の手引きにもなると思います。
特にPart 2 にある全8章(Chapter 5-12)がおすすめとのことです。

とりあえず、
2013年
1月17日(木)14:00-15:00 集まって分担の仕方など話し合い
1月31日(木)14:00-15:00 はじめる
という流れを考えていて、会場は医学部3号館S308を予定しています。

お仕事等をお持ちの方には平日の日中という、参加が難しい時間帯だとは思いますが、お時間が合えば、是非ご参加いただければと思います。

1月には参加できないけれど、今後参加したい、とか、曜日や日程のご要望などがおありでしたら、宮本まで是非ご連絡いただければ幸いです。月に2回くらい、各1時間くらいのペースを考えています。

                      宮本有紀

2012/08/07

次回も共分散構造分析 次回は2012年8月7日(火)18:30- (日程のみ再掲)

広告が出ちゃうので、日時ご案内だけ再掲。
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次回もSEMです。次回は火曜日です。

日 時:2012年8月7日(火)18:30~20:00
テーマ:共分散構造分析 (6)
場 所:医学部3号館 3階S308


いらっしゃる皆様、ご自分のPCにRをインストールし、さらにsemパッケージをインストールしてご持参いただければスムーズです。
ご関心のある方はどなたでも是非いらしてください。
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