次回 Cochrane Systematic Review 9月26日（木）14:30-

前回（8/22）のエビ研は、前々回に引き続き、Review Manager (RevMan)演習でした。
今回は、すでに出来上がっている表からではなく、論文から入力すべき結果を探し入力するということを行いました。
ただ、やみくもに入力しても合ってるかどうかもわからないのでは困るため、すでに出版されているCochrane　のSystematic Review　を準備し、そこで含められているRCTを資料として使って練習する、という形にしました。（使った資料は末尾に載せておきます。）

個人的には、今回は前回よりもスムーズに入力と操作ができたといいますか、 RevManってすごくよくできてるのね、ということがわかった回でした。
ただ、自分で論文から結果を読み取りながら入力していくのは、大変だということが よくわかりました。（それはRevManの操作の問題ではない。。。）

次回予告です。
次回から、Part 3: Special topics　に入ります。 やりたい部分をやりたい人が担当する、順番はどんな順番でもよし、 ということにします。

日　時：2013年9月26日（木）14:30-15:30
テーマ：Chapter 20. Qualitative research and Cochrane reviews
場　所：医学部3号館　3階　S308

ハンドブックはpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第20章（Qualitative research and Cochrane reviews）はp.571-591
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。

（文責：宮本有紀）

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前回（8/22）に使った資料

答え合わせに使ったCochrane Review：
独断で、当事者プロバイダー（病気の経験を有する人）と専門職によるサービス提供を比較したシステマティックレビューを選びました。
Pitt V, Lowe D, Hill S, Prictor M, Hetrick SE, Ryan R, Berends L.
Consumer-providers of care for adult clients of statutory mental health services.
Cochrane Database Syst Rev. 2013 Mar 28;3:CD004807. doi: 10.1002/14651858.CD004807.pub2.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23543537

実際に入力してみたデータ：
以下の2つの論文の結果を入力しました。
Bright JI, Baker KD, Neimeyer RA.
Professional and paraprofessional group treatments for depression: a comparison of cognitive-behavioral and mutual support interventions.
J Consult Clin Psychol. 1999 Aug;67(4):491-501.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10450619 

Rivera JJ, Sullivan AM, Valenti SS.
Adding consumer-providers to intensive case management: does it improve outcome?
Psychiatr Serv. 2007 Jun;58(6):802-9.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17535940

次回 Cochrane Systematic Review 8月22日（木）13:30- （RevMan演習）

前回（7/19金）のエビ研は、Review Manager (RevMan)演習でした。
基礎的な操作と数値の入力、ということで、RevManを講義で実際に操作したことのある方たちと一緒に数値を入力していました。
数値を入力していくと、美しくForest plotを作ってくれたり、Funnel plotを作ってくれたり、Fixed effect, Random effectsを選べたり、すごいー！！！という感じでした。
途中、サブグループを作るところは、私はうまくいかずに重複して作る形になっちゃったので、次回にまたやってみます。

次回予告です。
日　時：2013年8月22日（木）13:30-14:30
テーマ：Review Manager (RevMan)演習2
場　所：医学部3号館　3階　S308

次回は実際に論文から読み取って入力してみることをしてみたいと思っています。
（資料は準備します）

それぞれご自身のPCにRevManをインストールしてご参加ください。
下記のウェブサイトのDownloadというところから指示に従ってください。
http://ims.cochrane.org/revman

RevMan演習が終わった後に、ハンドブックのPart 3に入りたいと思います。ご自分の担当したい章があったらエビ研の時にお知らせください。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。資料の準備がありますので、可能であれば事前に宮本（yyuki-tky＠umin.ac.jp）までご連絡いただけるとありがたいです。

（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 7月19日（金）13:30- （再掲）

前回の記事から次回予告に関するところのみ再掲します。
（1ヶ月以上記事の更新がないと広告が表示されてしまうため。）

次回予告です。
日　時：2013年7月19日（金）13:30-14:30
テーマ：Review Manager (RevMan)演習
場　所：医学部3号館　3階　S308

それぞれご自身のPCにRevManをインストールしてご参加ください。
下記のウェブサイトのDownloadというところから指示に従ってください。
http://ims.cochrane.org/revman

次回はまずは基礎的な操作ということで数値を入力したり、RevManを操作してみます。
またその次の回にでも、実際に論文から読み取って入力してみることをしてみたいと思っています。（次々回の日程は次回決めます。）

RevMan演習が終わった後に、ハンドブックのPart 3（13章以降）に入りたいと思います。
ご自分の担当したい章があったらエビ研の時にお知らせください。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 7月19日（金）13:30-

前回（6/13）のエビ研は、Chapter12: Interpreting results and drawing conclusions　でした。
これで今年1月から取り組んできたPart2が終わりました！

まずは次回予告です。
日　時：2013年7月19日（金）13:30-14:30
テーマ：Review Manager (RevMan)演習
場　所：医学部3号館　3階　S308

それぞれご自身のPCにRevManをインストールしてご参加ください。
下記のウェブサイトのDownloadというところから指示に従ってください。
http://ims.cochrane.org/revman

次回はまずは基礎的な操作ということで数値を入力したり、RevManを操作してみます。
またその次の回にでも、実際に論文から読み取って入力してみることをしてみたいと思っています。（次々回の日程は次回決めます。）

RevMan演習が終わった後に、ハンドブックのPart 3（13章以降）に入りたいと思います。
ご自分の担当したい章があったらエビ研の時にお知らせください。

＜Chapter 12（6月13日）の感想＞
コクランは、そのレビューを読む人（読み手）が意思決定をするための資料を提供するんだ、という姿勢なのだということを今回とても感じました。
結果の評価にはGRADEを用いる、質の評価はバイアスや効果の大きさなども考慮して検討する、
p値と信頼区間は記載するべきだけれども、有意でない、というような表現はしない。小規模研究などは信頼区間が広がったり介入効果がごくわずか、というような結果となることもあるが、介入効果がない、と結論付けることではない、
などは、システマティックレビューを書くときだけでなく、自分が論文を読むときにもつながることだなぁと感じました。
また、Summary of findingsに尺度の最小値最大値も書いておく、というところを読んで、そもそもそれぞれの研究にも全て書いておかないとな、とあらためて気付きました。
安藤さん、どうもありがとうございました！

それからそれから、固定効果モデルと変量効果モデルの哲学の違い（真の値か分布か、など）について、以前エビ研で取り組んできたMixed Modelの頃からの積み重ねもあって、少しずつ感じられるようになってきた気がします。よねちゃんどうもありがとうございます。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 6月13日（木）13:30-

前回（6/7）のエビ研は、Chapter11: Presenting results and ‘Summary of findings’ tables　を股村さんにご担当いただきました。

Cochrane のレビューにかぎらず、Summary の書き方、表の名前の付け方、Abstractの書き方など、どれもとても大事なことだと思いました。
また、読者は誰なのか（Cochraneの場合は消費者・利用者・患者など）を意識して書くことの大切さも感じました。
股村さん、どうもありがとうございました！

次回の12章でPart 2は終わりますが、そのあとでReview managerに実際に入力してみる演習を行おうということになりました。

次回は第12章（Interpreting results and drawing conclusions）です。

日　時：2013年6月13日（木）13:30-14:30
テーマ：Cochrane Systematic Review 12章
場　所：医学部３号館　3階S308

（さらにその次は7/19（金）13:30-　　Review Managerを使う、の予定です。）

ハンドブックはpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第12章（ Interpreting results and drawing conclusions）はp.359-387です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 6月7日（金）13:30-

前回(5/13)のエビ研は、Chapter 9: Analysing data and undertaking meta-analyses の三回目、9.5 Heterogeneityからを続けて米倉さんにご担当いただきました。

ここで言うheterogeneityとは、システマティックレビューで扱われる研究におけるばらつき全てと言えると思います。参加者、介入やアウトカムのばらつき（variability）はclinical diversity：臨床的多様性 (時にclinical heterogeneity)、研究デザインのばらつきやバイアスのリスクはmethodological diversity：方法論的多様性（時にmethodological heterogeneity）とも言われます。異なる研究における介入効果のばらつきをstatistical heterogeneity：統計的不均質性（単にheterogeneityとも）と言い、これは先に述べた臨床的、方法論的多様性の結果生じています。
Heterogeneityをどのように検討し、どのように対処していくかや、解析については、名前（方法名？）を見てもピンと来なくて、道は遠い、、、と思ったりもしましたが、でもheterogeneity や sensitivity analyses については、自分の理解が進んだ気がする！と思ったり、でした。

米倉さん、3回にわたり、とても大変な章をご担当頂いた上にわかりやすくお伝え下さりどうもありがとうございました。

前々回に10章は終えていましたので、次回は11章 Presenting results and ‘Summary of findings’ tablesです。

日　時：2013年6月7日（金）13:30-14:30
テーマ：Cochrane Systematic Review 11章
場　所：医学部３号館　3階S308

（さらにその次は6/13（木）13:30-　　12章の予定です。）

ハンドブックはpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第11章（Presenting results and ‘Summary of findings’ tables）はp.335-357 です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 5月13日（月）10:30-

新緑の季節ですね。
前回（4/24）はChapter 10: Addressing reporting biases　を高野さんにご担当いただきました。
いろんなバイアスがあるなーってことがよくわかったのと、
バイアスがあるかどうかを確認するのも大変なんだなぁと感じました。
まぁ、大変もそうですが、バイアスはたぶんある、って思っておく方がよさそうだなとも感じました。

高野さん、ご準備ありがとうございました！

次回はまた9章の続きに戻ります。

日　時：2013年5月13日（月）10:30-11:30
テーマ：Cochrane Systematic Review 9章(9.5 Heterogeneityから)
場　所：医学部３号館　3階S308

（さらにその次は6/7（金）13:30-　　11章の予定です。）

5/13は前回9章で用いた資料をご持参ください。
ない方は宮本有紀（yyuki-tky＠umin.ac.jp）までご連絡をいただければと思います。

ハンドブックはpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第9章（Analysing data and undertaking meta-analyses）はp.243-296
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 4月24日（水）14:30-

前回（4/12）は9章 Analysing data and undertaking meta-analyses の
9.3 Study designs and identifying the unit of analysis　から
9.4 Summarizing effects across studies　までを行いました。

まず、前回の（9.1と9.2）の振り返りを簡単にしてもらってから9.3 Study designs and identifying the unit of analysis　に入りました。
報告バイアスについてや、イベントが複数回発生する場合、治療回数がいろいろな場合、複数の身体の部分に同じあるいは違う治療を受ける場合、複数の介入群がある場合などについては注意が必要だということでした。

9.4 Summarizing effects across studies　では、メタアナリシスの原則やweightが出てきました。random-effects meta-analysis(変量効果メタアナリシス）とfixed-effect meta-analysis（固定効果メタアナリシス）や、inverse-variance method（分散逆数重み付け法：IV法）といったものが印象に残りました。
二値データの場合にはどうするか？連続量では？変化量か最終時点での値か、データがゆがんでいる時は、順序データでは？回数カウントや発生率のデータは？Time-to-event型データでは？といろいろありました。これは実際に自分でRevManに入れてみるとより理解が進むのかなぁ、と思いました。
個人的にはvote counting(p.276)が気に入りましたが、これは最後の手段（last resort）なのだそうで。
というわけで、盛りだくさんな内容でした。

米倉さん、大変なご準備をどうもありがとうございました。一人では絶対に読み進める自信のない章でして、日本語にして言葉で説明してくださって本当に有り難く感謝しております。

次回は予定通り高野さんの10章にまずはいっていただき、その後で9章に戻る予定です。

日　時：2013年4月24日（水）14:30～15:30
テーマ：Cochrane Systematic Review (Chapter 10)
場　所：医学部３号館　3階S308→N304（図書室）

です。さらにその次は
5月13日（月）10:30-11:30　9章（9.5 Heterogeneity　から）
を予定しています。

資料はpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第10章（Addressing reporting biases）はp.297-333
第9章（Analysing data and undertaking meta-analyses）はp.243-296
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。資料の準備がありますので、可能であれば事前に宮本（yyuki-tky＠umin.ac.jp）までご連絡いただけるとありがたいです。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 4月12日（金）14:00-

前回（3/27）は、コクランレビューの8章と9章の途中まで行いました。

8章では特に、p.198のTable 8.5.c Criteria for judging risk of bias in the
‘Risk of bias’ assessment toolを見ながら、
実際にRoselineが準備してくれた
Cupples ME, McKnight A.
Randomised controlled trial of health promotion in general practice
for patients at high cardiovascular risk.
BMJ. 1994 Oct 15;309(6960):993-6.
をJudgeしてみるという演習を行いました。

9章では、二値データ、連続データ、順序データ、係数や割合、生存時間データについて、
risk ratio (RR), odds ratio (OR), risk difference (RD), numbers
needed to treat (NNT),
standardized mean difference (SMD),
などの使い方や注意点などを学びました。

ロザリン、よねちゃん、お忙しいところ、ご準備をどうもありがとうございました。

次回は
日　時：2013年4月12日（金）14:00～15:00
テーマ：Cochrane Systematic Review (Chapter 9)
（9.3 Study designs and identifying the unit of analysis　から）
場　所：医学部３号館　3階S308

です。
さらにその次は
4月24日（水）14:30-15:30　Chapter 10 Addressing reporting biases
を予定しています。

資料はpdf版だと↓の
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第9章（Analysing data and undertaking meta-analyses）はp.243-296
第10章（Addressing reporting biases）はp.297-333
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 3月27日（水）13:00-

前回（2/28）はコクランハンドブックのChapter 7 (Selecting studies and collecting data) について梅田さんがご発表くださいました。
以前何度かSystematic Reviewをした際に、Data collection formを作成するのに四苦八苦した身としては、システマティックレビューをし慣れている方の機能美あふれる（かどうかはわかりませんが）Formというのを見てみたいなぁと思いました。

また、どのようなデータをどのように抜き出すかを考えると、次から自分が論文を書く時に気をつけるポイントへの気付きが増えるだろうなぁと感じました。

次回は
日　時：2013年3月27日（水）13:00～15:00
テーマ：Cochrane Systematic Review (Chapter 8 and 9)
場　所：医学部３号館　3階S308
です。1章につき1時間の予定です。

pdf版↓　
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf
第8章（Assessing risk of bias in included studies) p.187-242
第9章（Analysing data and undertaking meta-analyses）p.243-296
です。各自ご準備をお願いいたします。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 2月28日（木）15:00-

前回（2/13）はコクランハンドブックのChapter 6を読みました。
MEDLINEとEMBASE、CENTRALはまず検索、ということや、grey literatureについて、報告書等の英文タイトル表記について、文献検索をする際の用語（AND ORだけでなく　NEAR NEXT ADJ）など、もっと早く知っていれば。。。。という内容でした。

こういったものをちゃんと勉強することの大切さを感じました。

次回は
日　時：2013年2月28日（木）15:00～16:00
テーマ：Cochrane Systematic Review (Chapter 7)
場　所：医学部３号館　3階S308
です。

pdf版だと↓の　p. 151-186 が次回の第7章になります。
http://xa.yimg.com/kq/groups/18751725/96463393/name/0470699515.pdf


ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 2月13日（水）10:00-

今回（1月31日）は、Chapter 5 (Defining the review question and developing criteria for including studies）を読みまして、Review Questionを決める際に考えることを確認したり、研究レビューを行う上で大事なことを話し合いました。
また、CochraneのReviewに掲載されている、Plain Language Summariesや、研究をみんなに分かる言葉で表現すること、どの相手に届けるかによって言葉も変わってくることなどについて話し合いました。
Cochrane reviewにかぎらず、どんなレビューを行なう上でも大事なことだなぁ、と感じることがたくさんあり、とても短い章でしたが、勉強になりました。

●2月下旬の日程変更　（2/27→2/28木へ。時間は午後へ）があります。ご確認をお願いいたします。
3月以降の日程は次回決めたいと思います。

次回以降の日程です。
2月13日（水）10：00-11：00
2月28日（木）15：00-16：00

次回は
日　時：2013年2月13日（水）10:00～11:00
テーマ：Cochrane Systematic Review (Chapter 6)
場　所：医学部３号館　3階S308
です。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

次回 Cochrane Systematic Review 1月31日（木）14:00-

前回からCochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions になりました。

次回は
日　時：2013年1月31日（木）14:00～15:00
テーマ：Cochrane Systematic Review (Chapter 5)
場　所：医学部３号館　3階S308

です。
次回以降の日程は
1月31日（木）14:00-15：00
2月13日（水）10:00-11：00
2月27日（水）10:00-11：00　→2月28日（木）15:00-16:00
です。
これ以降の日程は、2月の会で決めさせていただけたらと思います。

まずは、
Part 2: General methods for Cochrane reviews　の5章から12章をまず読むこととしました。
一回に1章くらいずつ進んで行けると良いかと思います。

参加者それぞれが目を通してくることを前提として、その章の担当者は簡単な資料で内容を紹介し（担当者が皆に全てを教えるのではなく）、参加者で話し合ったり自分の経験をシェアしたりしましょう、と話しています。

ご関心のある方はどなたでもいらしてください。
　　　　　　　　　　　　　　　　　（文責：宮本有紀）

共分散構造分析 2012年8月7日（火）18:30- の記録

2012年8月7日のエビ研の記録の下書きが途中まであったことに気付きました。
でも、残念ながら、続きがどれかわからなくなってしまいました。。。
何も記録がないよりは、少しはあるほうがまだ良いかと思い、中途半端ではありますが、アップさせていただきます。股村さん、ご発表ありがとうございました。せっかくのご発表だったのに不十分な記録でごめんなさい。

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前回（8月7日火曜日）のエビ研では、股村さんがご自分の研究の方法やデータを見せてくださり、SEMについて学びました。

シンプレックスモデル：auto-regression model
(交差遅延モデル：cross lagged model)

潜在曲線モデル　
Hierarchical　growth modelと潜在変数を使ってるかどうかの違いであって、やってることは同じ。

Intercept mean variance
Slope

T1, T2, T3, T4, Time

T1 = Intercept
T2 = Intercept + Slope
T3 = Intercept + 2* slope
Tk = Intercept + Slope * time

重回帰モデルだとvarianceは出てこない。

Intercept は人によって違う
Slope　は人によって違う
個人ごとにばらつきがある

Mixed modelならばらつきが出る。

潜在曲線モデルはパス係数を固定する

SEMはMixed model よりできることが多い

Mixed Modelでは、InterceptとSlopeのVARIANCEと平均を推定するところで終わりだが、SEMはそれを従属変数にしたりもできる。

SEMは従属変数に二値変数はだめ　説明変数にする分にはまぁ構わない

エビ研を2012年9月28日（金）に行いました

気づいてみれば、ずっとエビ研のブログを更新していなかった事に気づきました。
9月28日にもエビ研を開催したのに、その予告すら載せておりませんでした。
もしも、ここで見てくださっていた方がいらっしゃったとしたら、申し訳ありませんでした。

9月28日（金）は、SEMで、Roselineがご自分の研究データを紹介してくれながら勉強会を行いました。
Roseline、よねちゃん、どうもありがとうございました。

当日のメモを見つけられずにいますが、また見つけたらアップします。。。

次回からシステマティックレビュー 2013年1月17日（木）14:00-

お久しぶりのエビ研のご案内です。
このところ共分散構造分析（SEM）をテーマとしてきましたが、次回から
システマティックレビューについて学ぶことをテーマにしたいと思います。

しばらく
Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions
を読む会にしようと話しています。

まずは次回予告です。
日　時：2013年1月17日（木）14:00～15:00
テーマ：Cochrane Systematic Review (分担など)
場　所：医学部３号館　3階S308

Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventionsについて

このハンドブックは、下記から無料でダウンロードできますし、
http://www.cochrane.org/training/cochrane-handbook
本（ISBN: 978-0-470-69951-5)として
WileyやAmazon.comから購入することもできます。
コクランレビューを執筆するためのハンドブックとしてももちろんですが、普通にシステマティックレビューをする時の手引きにもなると思います。
特にPart 2 にある全8章（Chapter 5-12)がおすすめとのことです。

とりあえず、
2013年
1月17日（木）14:00-15:00　集まって分担の仕方など話し合い
1月31日（木）14:00-15:00　はじめる
という流れを考えていて、会場は医学部3号館S308を予定しています。

お仕事等をお持ちの方には平日の日中という、参加が難しい時間帯だとは思いますが、お時間が合えば、是非ご参加いただければと思います。

1月には参加できないけれど、今後参加したい、とか、曜日や日程のご要望などがおありでしたら、宮本まで是非ご連絡いただければ幸いです。月に2回くらい、各1時間くらいのペースを考えています。

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　宮本有紀